1989年3月，孙长全应征入伍，成为一名光荣的解放军武警战士。新兵连训练结束，他任代理副班长。1990年6月，被中队嘉奖一次。8月，正式担任副班长，他所带的班训练成绩名列前茅，孙长全受到连队嘉奖一次。10月，在支队组织的阅兵式、分列式训练中，他虚心请教，勤学苦练，被评为“训练标兵”。
这一年，孙长全参加了执行制止枫亭宗族械斗、打击车匪路霸以及查缉鳗鱼苗走私、围捕凶杀要犯等一系列艰巨任务，每次都是奋不顾身完成任务。他始终依法、文明执勤，多次被聘为擒敌教练员。在支队组织的军事项目竞赛中，孙长全获得了4个项目的个人第一，被支队评为“四会”教练员和“执勤能手”。
1991年初，孙长全担任班长，他精心组织，圆满地完成了军事汇报表演活动，受嘉奖一次。4月21日，加入中国共产党，并作为优秀战斗班长参加了选拔预提警官培训。
1991年8月2日晚9点30分许，孙长全和他的战友华加林在执勤巡逻时，与手持利刃、棍棒在挑衅肇事的10多个歹徒顽强搏斗，英勇牺牲。
孙长全牺牲以后，武警福建省总队为他追记二等功，并追认他为革命烈士。
