1943年秋冬之际，由于俞惕庵在汤园区搞财粮工作成绩显著，调任掘马南区区委委员、区财经分局主任。1944年6月被提拔为副区长，秋后升为区长。
1943～1944年，掘马南区的抗日斗争处于十分艰苦残酷的时期，俞惕庵分工负责的西片(包括孙窑乡、曹埠乡和堤南乡)，处在敌人包围圈内，仅有五六华里的地方。他带领财经干部，深入到边区开展征税工作，甚至潜入敌占区内征税。他十分重视敌占区的统战工作和青年工作，把可团结的各阶层人士都团结起来，为抗日斗争服务。他重视对干部的教育和培养，曾把十几名在职财经干部，送往分区财经训练班学习。他说：“抗日战争即将胜利，那时需要大批财经干部，现在送人去学习，对工作有点影响，但将来会大有用处。”
1944年12月中旬，俞惕庵带领工作组到曹埠乡进行废除保甲制，实行新乡制工作试点。12月13日，他主持召开各乡主要干部会议后，被敌军包围。在他的掩护下，一部分同志冲出了敌人的包围圈，可他却不幸中弹牺牲。
