1927年“四一二”反革命政变后，苏德馨深入城乡，秘密发展和壮大共产党的基层组织。7月，国民党江苏省清党委员会派成昌五为特派员，接管国民党如皋县党部，企图实现“清党”。苏德馨和中共如皋县委其他成员一起，领导如皋师范学生游行示威，抗议成昌五接管县党部。并组织200多位社会名流联名向省控告，揭露其罪恶，这位“清党”大员终被革职查办。
1927年8月，传闻军阀孙传芳要重占如皋，乐济安拐带公款13000余元弃职逃往上海。孙军反扑失败，乐济安回如皋企图复任。苏德馨召开地方各团体联席会议，组织“如皋县惩乐委员会”，清理乐济安帐目，上告省民政厅，迫使省民政厅重新委派县长，并将乐济安关押，限期退出公款。
1928年5月1日，震撼大江南北的如皋西乡农民暴动开始了，苏德馨任暴动指挥部肃反委员，先后率队攻打徐家庄公安分局、卢港地主庄园。暴动失败后撤往上海，被省委农委书记王若飞派回如皋东乡任中共马塘中心区委书记，代号“白公挈”。 6月15日在银杏埠附近活动时，因奸人发现告密而被捕。国民党如皋县长王浩然威逼利诱，并以杀死他父亲相威胁，他严正地说：“我是共产党，父亲是老百姓。你们不但要杀共产党，也要杀老百姓，这是三民主义吗?”敌人继而又以酷刑摧残，但丝毫不能动摇他的革命信念。他在狱中给四弟君熙和妻子分别写下遗书，要四弟代为孝敬父母，嘱托妻子抚育好刚满周岁的儿子，并将儿子改名“苏维宜”(“苏维埃”谐音)，希望儿子长大后继承革命遗志。
7月8日晨，苏德馨被押往如城南门小校场刑场，母校如皋师范的学生闻讯赶来，见状不禁失声痛哭，他大声说：“你们不要难过，我倒下去了，将会有更多不甘屈服的人站起来为中国革命奋斗!”
